ist bzw wäre das dann nicht ne AGG diskriminierung? religion?

Nein, das ist keine Diskriminierung:
Der kirchlische Arbeitgeber darf die Angestelltenverhältnisse selbst regeln. Und Überprüfen kann er das Vorhandensein einer Konfession durch Vorlage einer Taufurkunde und der Einzahlungsbestätigung des Kirchenbeitrages.