Rechtschreibung lernen

"Wenn die Rechtschreibung bewertet würde, hätte er ganz schnell gar keine Lust mehr auf Schule, denn die beherrscht er solala. "

Gut, dann ist dein Sohn super in Mathe, hat aber an anderer Stelle seine Defizite.
Warum sollen die nicht berücksichtigt werden?
Kinder, die eine Rechenaufgabe falsch rechnen müssten dann - nach deiner Argumentation - auch keine Lust mehr auf Schule habe.
Schule bedeutet jedoch nicht: Ich komme dahin und mache gleich alles richtig.
Fehler zu machen gehört zum Lernprozess einfach dazu.

"ABER: wenn er Punkte abgezogen bekäme, würde er sich sicher nicht so sehr anstrengen oder müsste sehr viel Zeit und Energie auf die Rechtschreibung verwenden. "

Ja, du hast Recht, er müsste mehr Energie auf die Rechtschreibung verwenden.
Warum sollte es dein Sohn nicht machen müssen??

Zum konkreten Fall: Fachwörter in Arbeiten (ob nun Mathe oder Sachunterricht) werden als Rechtschreibfehler angestrichen. Das wissen meine Schüler übrigens auch, ich sage es regelmäßig im Unterricht (so wie der Hinweis, dass eine fehlende Maßeinheit zum Punktabzug führt).