Daran mag es liegen...

.. nur so als spontaner Einfall: Da er offensichtlich noch nie jemanden nackt gesehen hat und das Thema Nacktheit bei euch offenbar eher schambesetzt ist, will bzw. muss er halt selbst rausfinden, wo die Unterschiede sind.

Da hilft nur erklären, Bücher anschauen, zeigen. Am lebenden Objekt!!

Ansonsten sieht das Verhalten deines Sohnes zwar merkwürdig aus, aber wenn du sicher bist, dass er noch nirgends komische Sachen gesehen bzw. Erfahrungen gemacht hat (evt. bei anderen Kiga-Kindern abgekuckt?), dann meint er das auch nicht "schlimm". Interessant wäre ja auch, was das Mädel gemacht hat: ihn einfach machen lassen, mit welchem Gefühl, war es beiderseitiges Interesse oder nur seins? Darüber solltet ihr unbedingt mit beiden Kindern reden.
Und vor allem: Auch wenn es wichtig ist zu betonen, dass es eine Privatsphäre und persönliche Intimzonen etc. gibt, die Episode nicht dramatisieren - sonst wird das Thema als Tabu erst recht spannend (und potenziell konfliktbesetzt...)!!

Lg
Jenny