Brauche mal ehrliche Meinungen...

Das finde ich von deinem Mann echt nicht in Ordnung. Emilian ist ein wunderschöner Name und auch viel seltener als Jannik, wäre definitiv meine Präferenz.
Ich finde, wenn einer beim ersten Vornamen federführend ist, sollte man beim zweiten Vornamen dem anderen den Vortritt lassen.
Bei uns hat auch mein Mann den ersten Vornamen ausgesucht, den zweiten ich. Ich würde an deiner Stelle hart bleiben und wenn er nicht einsichtig ist, den Kleinen selbst beim Standesamt anmelden und den zweiten Vornamen einfach festlegen. Als Mutter hast du die ganzen Strapazen von Schwangerschaft und Geburt zu bewältigen, da sollte der Mann mal seine Ansprüche zurück stellen.